總的來說，風光互補發電系統的效率分別受光伏發電效率、風力發電效率影響，具體來說，風光互補發電系統的輸出效率會受到光照強度、灰塵、雨水、風速、太陽高度角和地理緯度、大氣透明度和海拔高度、日照時間、溫度變化、傳動系統、發電機、葉片及其組件的耗損等的影響。

　　風力發電效率

　　風力發電系統中影響其發電效率的主要因素有風速、傳動系統、發電機、葉片以及控制系統，其中風輪機對風能的利用系數與發電機效率是很重要的影響因素。建設風力發電場的各個地區平均風速不同，也會影響風力發電效率。

　　光伏發電效率

　　光伏發電效率是由組成光伏發電系統的各個構件的效率決定的，光伏發電系統需要蓄電池組來保證系統發電的穩定性，而蓄電池組的輸出效率主要受到灰塵、雨水、溫度變化及其組件的耗損等的影響。自然環境也會影響其效率，影響因素主要包括太陽高度角和地理緯度、大氣透明度和海拔高度、日照時間、光照強度等。

　　風力發電的優點是不消耗任何化石燃料，因而就不會排放二氧化硫（SO2）、二氧化碳（CO2）、甲烷（CH4）、氧化亞氮（N2O）、氫氟碳化合物（HFCs）等有害氣體以及溫室氣體，可以說風能是最清潔且用之不竭的可再生能源。到2010年底，我國首次超過美國，在風力發電累計裝機容量上占據了世界第一的位置。據統計，我國累計裝機容量達到了4182.7萬kW，煙臺、威海、濰坊、東營等沿海區域建設了十多個風電場，主要配置了單機容量300kW、600kW、1.25MW、1.5MW、2MW（目前國內最大的單機運行容量）的機型。

　　在風電機組中，許多設備本身或其某一部分元器件是旋轉式運轉的，故常因機械損耗或軸承缺陷而產生異常振動，進而發出轉動機械產生的噪音，還會由于接觸面與附著面間的滑移現象而發出摩擦產生的噪音，而且風電機組本身就是依靠空氣流動獲得能量，所以空氣流動所產生的氣動噪音、亂流、噴射流、氣蝕、氣切、渦流等現象也是難以避免的，空氣在高速流經導管或金屬表面時碰到阻礙產生亂流或遇到大而急速的壓力改變均會產生噪音。