此前討論頗多的自然資源和生態環境管理體制改革方案終于揭開面紗。這個方案并未如一些人士猜測，將國有自然資源資產管理和自然生態監管機構合一，而是擬分別組建國土資源部和生態環境部。

根據3月13日上午公布的《國務院關于提請審議國務院機構改革方案的議案》，國務院擬組建自然資源部，將國土資源部的職責，國家發改委的組織編制主體功能區規劃職責，住建部的城鄉規劃管理職責，水利部的水資源調查和確權登記管理職責，農業部的草原資源調查和確權登記管理職責，國家林業局的森林、濕地等資源調查和確權登記管理職責，國家海洋局的職責，國家測繪地理信息局的職責整合，組建自然資源部，作為國務院組成部門。自然資源部對外保留國家海洋局牌子。

同時，不再保留國土資源部、國家海洋局、國家測繪地理信息局。

不過，按照這個方案，現屬農業部的農地確權登記管理職責，并未納入。

國務院擬組建生態環境部，將環保部的職責、國家發改委的應對氣候變化和減排職責，國土部的監督防止地下水污染職責，水利部的編制水功能區劃、排污口設置管理、流域水環境保護職責，農業部的監督指導農業面源污染治理職責，國家海洋局的海洋環境保護職責，國務院南水北調工程建設委員會辦公室的南水北調工程項目區環境保護職責整合，組建生態環境部，作為國務院組成部門。生態環境部對外保留國家核安全局牌子。不再保留環境保護部。

與此同時，改革自然資源管理和監督體制，中共十八屆三中全會就有安排，中共十九大又再做部署。2月28日中國共產黨第十九屆中央委員會第三次全體會議通過的《中共中央關于深化黨和國家機構改革的決定》明確，改革自然資源和生態環境管理體制。實行最嚴格的生態環境保護制度，構建政府為主導、企業為主體、社會組織和公眾共同參與的環境治理體系，為生態文明建設提供制度保障。

設立國有自然資源資產管理和自然生態監管機構，完善生態環境管理制度，統一行使全民所有自然資源資產所有者職責，統一行使所有國土空間用途管制和生態保護修復職責，統一行使監管城鄉各類污染排放和行政執法職責。強化國土空間規劃對各專項規劃的指導約束作用，推進“多規合一”，實現土地利用規劃、城鄉規劃等有機融合。